Онлайн-налагодження полягає у подальшому здійсненні онлайн-налаштування програми за допомогою моделювання налагодження. Процес онлайн-налагодження повинен тривати поетапно, починаючи з контролера PLC Mitsubishi, підключаючи лише пристрій введення, потім підключаючи пристрій виводу, а потім підключаючи до фактичного навантаження. Якщо він не відповідає вимогам, відрегулюйте обладнання та процедури. Зазвичай потрібно лише змінити частину програми.
Після завершення налагодження воно доставляється для пробної експлуатації. Після запуску протягом певного періоду, якщо вона працює нормально і програму не потрібно модифікувати, програму слід затвердити в EPROM, щоб запобігти втраті програми.